中国人民解放军第5军的前身是新疆民族军。
　　

　　 1944年9月2日,新疆北部尼勒克县乌拉斯台地区人民为反抗国民党反动统治,争取政治民主,民族平等,举行武装暴动。不久,这场暴动发展到伊犁、塔城、阿勒泰地区,亦称"三区革命"。1945年4月8日,在伊宁以暴动队伍组成的游击队指挥部为基础,成立新疆民族军。帕里诺夫任总指挥,祖农·太耶夫任副总指挥,玛加诺夫任参谋长,阿不都克里术·阿巴索夫任政治部主任,下辖8个团又4个营,共1.5万余人。7月,民族军主力向塔城、阿勒泰地区进军,尔后挺进准噶尔腹地。9月下旬,进抵玛纳斯河西岸,与国民党军隔河对峙,威胁迫化（今鸟鲁术齐）。此时,民族军发展到13个团共3万余人。1946年6月,民族军按照三区临时政府与国民党政府谈判签定的以和平方式解决武装冲突之条款（即"11项和平条款"）进行整编,部队减为6个团共1.3万余人.1947年,国民党政府撕毁协议,武装进攻阿勒泰和玛纳斯地区,民族军奋起抗击,保卫了三区.从1948年起,民族军参照人民解放军的政治工作原则教育部队,官兵关系和军民关系得到改善。1949年10月,民族军为接应人民解放军入疆,自玛纳斯河以西分别进至东疆和南疆。12月上旬,一部到达迪化,与第一野战军第1兵团会师。根据中央军委命令,1950年1月10日-民族军在伊宁改编为中国人民解放军第5军,列斯肯任军长,顿星云任政治委员,马尔果夫·伊斯哈科夫任副军长兼参谋长,曹达诺夫·扎伊尔任副政治委员,努力耶夫任政治部主任,辖第13、第14师和2个骑兵团,共1.3万余人,归第一野战军暨西北军区建制。1950年春,全军投入大生产运动,并以一部兵力配合第6军清剿武装土匪。1952年7月,组建第15师。1953年5月,由第13师组建喀什军分区,第14、第15师改编为农建第3、第4师。1954年10月,第5军军部改编为新疆哈萨克自治区军区(后改为伊掣军区),第5军番号即予撤销.

　　 第5军在创建和发展过程中,坚持反对国民党反动统治的武装斗争,牵制了国民党在新疆的军事力量。涌现出孜赫肉拉·那的诺夫、阿不都拉提夫·库尔板诺夫等英雄模范,为新疆和平解放相边疆建设做出了贡献。